La sección de ecosistemas marinos emergidos, se inicia en la zona polar, seguido por el ecosistema de manglar (en ciénagas y estuarios), de acantilados y el de playas.     Los Manglares constituyen el grupo de plantas mas importantes de los ecosistemas costeros. Se encuentran en el ambiente de transición o límite entre el medio acuático y el terrestre es decir, en los lugares donde el río se encuentra con el mar formando zonas de extensos bosques (Estuarios y Ciénegas). Las raíces sumergidas del mangle rojo sirven de base o estructura a diversos animales tales como esponjas, cangrejos, peces, caracoles, ostras, camarones etc, mientras que las ramas, los troncos y las hojas sirven a diferentes aves, caracoles, hormigas y a muchos otros animales terrestres. Aves Marinas Estuarinas . Las Garzas son aves zancudas de cuello y patas largas, con plumas de adorno. Presentan una membrana paqueña. Recien nacidos son desnudos. Se alimentan de peces y otros animales acuáticos. El Flamenco Rosado es el único flamenco presente en Colombia, en el litoral Caribe y en la Península de la Guajira. Su aspecto es inconfundible en razón de la gran longitud de cuello, pico y patas. Como su nombre lo indica son de color rosado. Para obtener su comida filtran el agua y el barro con unas laminillas que poseen internamente en su pico. Ponen dos huevos y los padres se turnan para calentarlos; se pueden observar que mientras uno los calienta, el otro hace guardia cerca del nido. Las Gaviotas son en general de habitos costeros. Se alejan unas millas de la playa siguiendo a buques y a embarcaciones menores en busca de alimento. Estas aves son inconfundibles debido al color blanco de su plumaje, con un manto de plumas negras que va de extremo a extremo de sus alas incluyendo el dorso del cuerpo. Se alimentan de animales marinos como erizos, estrellas, peces y también de desperdicios que son arrojados desde los buques, principalmente los pesqueros. Estas aves se encuentran en bandadas.