A nivel nacional e internacional, las aguas de lastre presentan uno de los mayores problemas ambientales, ya que favorecen a la propagación de virus y bacterias patógenas, incluyendo la bacteria que causa el cólera, además de la introducción de especies, nocivas o toxicas alterando la ecología nativa y posiblemente dando apertura a nuevas enfermedades, creando así un desequilibrio en el medio marino o en los ecosistemas aledaños a estas zonas.
Poder identificar taxonómicamente a nivel molecular crustáceos invasores (zooplancton) que llegan por aguas de lastre al territorio Colombiano, es muy importante para complementar la taxonomía alfa (morfología), ya que puede confirmar y en otros casos aportar genero y especie de estos organismos invasores. Con este conocimiento es posible trazar planes de manejo de estos organismos.