El Comité de la Facultad cumple funciones de coordinación, asesoría y optimización de procesos académico-administrativos que estén asociados con las responsabilidades y programas de la misma; también actúa como Comité de Investigación y Creatividad. Está conformado por el decano de la Facultad, los directores de departamentos y los directores de centros, de conformidad con el artículo 16 del Acuerdo 29 de 2009 del Consejo Directivo de la Universidad.
- Decano de la Facultad de Ciencias Naturales e Ingeniería
Isaac Dyner Rezonzew
- Director del Departamento de Ciencias Básicas
Favio Cala Vitery
- Director del Departamento de Ciencias Biológicas y Ambientales
Andrés Franco Herrera
- Director del Departamento de Ingeniería
Edgar Mauricio Vargas Solano
- Director del Centro de Bio-sistemas
Oscar Alberto Duarte Torres
- Director del Centro de Robótica e Informática
Edgar José Ruíz Dorantes
Como invitados, asisten los siguientes funcionarios:
- Director Maestría en Ciencias Ambientales
Edilberto León Peña
- Coordinador de Ingeniería de Alimentos
Ligia Inés Rodríguez Piedrahita
- Coordinador de Ingeniería Industrial
Eliasib Naher Rivera Aya
- Coordinador de la Especialización de Desarrollo de Bases de Datos
Rafael Hernández Moreno
- Jefe de Laboratorios y Talleres
Luer León Vargas
- Coordinador Maestria en Gestión Sostenible de la Energía
Andrés Julian Aristizabal
- Coordinador Maestria en Ingeniería de Procesos y Sistemas Agroindustriales
Byron Yepes