Cursó estudios de pregrado en Ingeniería Agronómica en la Universidad Nacional de Colombia y de doctorado de Ingeniería en Biociencias en la Universidad Católica de Lovaina de Bélgica.
En sus investigaciones en sistemas de producción primaria ha integrado herramientas de modelado y simulación, tanto estocásticas como determinísticas, para el estudio del continuo clima-suelo-planta.
Uno de sus principales intereses es la inclusión de modelos de crecimiento de cultivos y de otros componentes del ambiente como el suelo, para introducirle dinámica a herramientas de impacto ambiental como el análisis de ciclo de vida. Y ha utilizado diferentes tipos de modelos para analizar la incertidumbre relativa, debida a la variabilidad intrínseca de los sistemas productivos.
Ha publicado veinticinco artículos indexados en la base Scopus durante 2013 y 2014 y cinco en revistas indexadas también en Scopus. En la actualidad es el profesor de la Facultad con el índice H más alto: 5. (El índice H mide la relación entre el número de artículos publicados y el número de citaciones de estos artículos). Lidera un grupo de investigación clasificado en la Categoría B de Colciencias
Por segundo año consecutivo, Carlos Ricardo Bojacá Aldana, del Departamento de Ciencias Básicas de la Facultad de Ciencias Naturales e Ingeniería, es el profesor distinguido en Ciencia.